Всё зависит от исходных данных. Если у тебя WAV рип сделан качественно, как положено.. либо ты его качал с торрентов на которых следят за качеством рипов, то можешь запихивать WAV.
Если хочешь записать диск, то пиши его с помощью EAC. Но опять же, исходник должен быть качественным.
И при таких условиях разницы не будет диск или WAV на флешке. Я, например, записывал на 2 флешки под завязку, а когда их стало не хватать, то записывал диски с той музыкой, которую я слушаю не так часто.